Fünf Saisons spielte Jena ununterbrochen in der 3. Liga seit dem Abstieg 2012 und konnte dabei stets einen einstelligen Tabellenplatz erreichen. Mit dem neuen Cheftrainer Mark Zimmermann gelang schließlich dieses Jahr der Aufstieg. Bereits drei Spiele vor Schluss qualifizierte sich der dreifache DDR-Meister für die Aufstiegsspiele, in denen sich die Thüringer aufgrund mehr erzielter Auswärtstore gegen Viktoria Köln durchsetzten. Eine Woche vor dem Ligastart testete Jena gegen den Bundesligisten Hertha BSC Berlin und unterlag in der Generalprobe knapp mit 0:2.
Mediale Aufmerksamkeit erlangte Jena vor wenigen Tagen, als der Club bekannt gab, für die "Wacken Foundation" auf der Trikotbrust zu werben. Die Band "Heaven Shall Burn", die bislang als Trikotsponsor die Jerseys des Ostklubs zierte, überließ der Stiftung den Werbeplatz. Die Foundation wurde einst von den Veranstaltern des bekannten Heavy-Metal-Festivals gegründet worden und unterstützt Musiker aus dieser Szene.
Gründungsjahr: 1903
Stadion: Ernst-Abbe-Sportfeld (12.990 Zuschauer)
Trainer: Mark Zimmermann
Größte Erfolge: DDR-Meister 1963, 1968, 1970, Finalist Europapokal der Pokalsieger 1981
Platzierungen der letzten fünf Jahre:
2013: 2., 2014: 3., 2015: 4., 2016: 7., 2017: 1. (alle Regionalliga Nordost)
16. Spieltag: 18.11.2017, 14 Uhr: Carl Zeiss Jena - Werder U 23 (Regelanstoßzeit, noch nicht fix terminiert)