Der DFB-Pokal der Junioren startet, sofern auch hier die behördlichen Freigaben vorliegen, am 3. Oktober 2020 mit der ersten Runde. Die Meldefrist für die Landespokalsieger wurde vom DFB-Jugendausschuss auf den 6. September 2020, 23.59 Uhr, festgelegt. Sollte ein Landespokal nicht abgeschlossen werden und damit kein Landespokalsieger feststehen, kann der Landesverband innerhalb der Frist in eigener Verantwortlichkeit einen Teilnehmer melden. Wird mit Fristablauf kein Teilnehmer gemeldet, erhält der bestplatzierte, nicht bereits anderweitig teilnahmeberechtigte Verein der A-Junioren-Bundesliga-Staffeln 2019/2020 aus dem betreffenden Verbandsgebiet den Startplatz.