Zugänge
| Name | Status | Nationalität | Position | Verein |
|---|---|---|---|---|
| Raphael Wolf | ab 01.07.2012 |
| Torhüter | SV Kapfenberg |
| Richard Strebinger | ab 01.07.2012 |
| Torhüter | Hertha BSC |
| Assani Lukimya | ab 01.07.2012 |
| Abwehr | Fortuna Düsseldorf |
| Theodor Gebre Selassie | ab 01.07.2012 |
| Abwehr | FC Slovan Liberec |
| Nils Petersen | ab 01.07.2012 |
| Sturm | FC Bayern München |
| Eljero Elia | ab 01.07.2012 |
| Mittelfeld | Juventus Turin |
| Kevin De Bruyne | ab 02.08.2012 |
| Mittelfeld | FC Chelsea |
| Joseph Akpala | ab 23.08.2012 |
| Sturm | FC Brügge |
| Mateo Pavlovic | ab 01.01.2013 |
| Abwehr | NK Zagreb |
Abgänge
| Name | Status | Nationalität | Position | Neuer Verein |
|---|---|---|---|---|
| Tim Wiese | ab 01.07.2012 |
| Torhüter | 1899 Hoffenheim |
| Mikael Silvestre | ab 01.07.2012 |
| Abwehr | Ziel unbekannt |
| Marko Marin | ab 01.07.2012 |
| Mittelfeld | FC Chelsea |
| Tim Borowski | ab 01.07.2012 |
| Mittelfeld | Karriereende |
| Markus Rosenberg | ab 01.07.2012 |
| Sturm | West Bromwich Albion |
| Claudio Pizarro | ab 01.07.2012 |
| Sturm | FC Bayern München |
| Lennart Thy | ab 01.07.2012 |
| Sturm | FC St. Pauli |
| Naldo | ab 17.07.2012 |
| Abwehr | VfL Wolfsburg |
| Sandro Wagner | ab 19.07.2012 |
| Sturm | Hertha BSC |
| Denni Avdic | ab 29.08.2012 |
| Sturm | PEC Zwolle |
| Francois Affolter | ab 31.12.2012 |
| Abwehr | BSC Young Boys |
| Florian Trinks | ab 31.01.2013 |
| Mittelfeld | SpVgg Greuther Fürth |
